Nieuwe instrumenten voor functionele beeldvorming van de darm organoïden
Over deze onderzoekslijn
Volwassen stamcellen en iPSC-afgeleide darmorganoïden vergroten ons begrip van de ontwikkeling van darmepitheel, gastheer-microbe-interactiestudies en weefselmanipulatietoepassingen. Recent onderzoek onderstreept het belang van benaderingen met hoge resolutie en live microscopie voor een beter begrip van organoïde heterogeniteit en metabolisme. We waren een pionier in FLIM- en O2 PLIM-beeldvorming van organoïden door hun oxidatieve metabolisme aan te pakken en momenteel de beschikbare biosensor-toolkit uit te breiden voor verbeterde multi-factor beoordeling van eencellig metabolisme en lot in de organoïden via niet-invasieve live en multi-parameter FLIM-microscopie.
De consolidatie van deze benaderingen zal een beter inzicht van het weefselgenezingsproces bij patiënten met inflammatoire darmaandoeningen (IBD) mogelijk maken, verbeterde modellering van gastheer-microbe-interacties opleveren en de rol van ijzer in de voeding in de homeostase van darmcellen onthullen.
Publicaties
- Okkelman IA, Neto N, Papkovsky DB, Monaghan MG, Dmitriev RI: A deeper understanding of intestinal organoid metabolism revealed by combining fluorescence lifetime imaging microscopy (FLIM) and extracellular flux analyses. Redox Biology 2020, 30:101420.
- Okkelman IA, McGarrigle R, O’Carroll S, Berrio DC, Schenke-Layland K, Hynes J, Dmitriev RI: Extracellular Ca2+-Sensing Fluorescent Protein Biosensor Based on a Collagen-Binding Domain. ACS Applied Bio Materials 2020, 3(8):5310-5321.
- Okkelman IA, Foley T, Papkovsky DB, Dmitriev RI: Live cell imaging of mouse intestinal organoids reveals heterogeneity in their oxygenation. Biomaterials 2017, 146:86-96.
- O'Donnell N, Okkelman IA, Timashev P, Gromovykh TI, Papkovsky DB, Dmitriev RI: Cellulose-based scaffolds for fluorescence lifetime imaging-assisted tissue engineering. Acta Biomaterialia 2018, 80:85-96.
Vragen?
- Ruslan Dmitriev, professor/hoofd van de groep
09 332 51 33